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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

秦始皇兵马俑考古新突破：初步厘清秦军军阵排列规律 新发现220余件陶俑******

　　新华社西安1月12日电(记者 杨一苗)扫荡六国、一统天下的秦军如何排兵布阵？秦陵陶俑制作流程如何？这些千古之谜的答案已开始浮出历史的水面。陕西省文物局12日发布了2022年度陕西重要考古发现，其中秦始皇帝陵考古发掘又有新收获，考古工作者对陵园外围的大型陪葬坑——一号坑进行了持续十余年的第三次考古发掘，新发现陶俑220余件，并初步厘清军阵的排列规律，还明确了秦陵陶俑的制作程序。

　　一号坑的第三次考古发掘开始于2009年，发掘面积约430平方米，目前共清理陶俑220余件、陶马16匹、战车4乘，以及车马器、兵器、生产工具等。

　　据秦始皇帝陵博物院研究员申茂盛介绍，一号坑的建筑结构为框架式，与厢椁式陪葬坑相比技术较为原始，可推知其在陵园中修建较早。同时，这次考古发掘还取得了多项突破：明确了武器的种类与配属，清理出俑坑中第一面盾牌，确认了特殊俑的职能，并初步厘清军阵的排列规律。申茂盛说，此次考古发掘还明确了陶俑的制作程序：陶俑在塑出大型后，先作细部雕饰，然后再粘接双臂。

　　秦兵马俑陪葬坑是秦始皇帝陵园外围的一组大型陪葬坑，其中一号坑面积最大，平面呈长方形，总面积14260平方米，按照排列密度估算，全部发掘后可出土陶俑、陶马约6000件。(新华网)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）